MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 73276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927460
2	NC_011898	CTG	2	6	166	171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927460
3	NC_011898	TAA	2	6	176	181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
4	NC_011898	A	6	6	215	220	100 %	0 %	0 %	0 %	220927460
5	NC_011898	ATTT	2	8	255	262	25 %	75 %	0 %	0 %	220927460
6	NC_011898	GGAAAC	2	12	369	380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220927460
7	NC_011898	GCTG	2	8	401	408	0 %	25 %	50 %	25 %	220927460
8	NC_011898	ATGC	2	8	483	490	25 %	25 %	25 %	25 %	220927460
9	NC_011898	TCA	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927460
10	NC_011898	GAT	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
11	NC_011898	GAA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
12	NC_011898	GAAA	2	8	665	672	75 %	0 %	25 %	0 %	220927460
13	NC_011898	GAA	3	9	678	686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
14	NC_011898	CCT	2	6	750	755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927460
15	NC_011898	TGA	2	6	893	898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
16	NC_011898	ATA	2	6	996	1001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
17	NC_011898	CAA	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927460
18	NC_011898	ATT	2	6	1056	1061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927460
19	NC_011898	AAG	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
20	NC_011898	TGA	2	6	1115	1120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927460
21	NC_011898	AGA	2	6	1134	1139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927460
22	NC_011898	TC	3	6	1203	1208	0 %	50 %	0 %	50 %	220927460
23	NC_011898	GGT	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927460
24	NC_011898	TAA	2	6	1274	1279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
25	NC_011898	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927460
26	NC_011898	AAC	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927461
27	NC_011898	GAT	2	6	1709	1714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
28	NC_011898	ATGTT	2	10	1756	1765	20 %	60 %	20 %	0 %	220927461
29	NC_011898	AAG	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
30	NC_011898	TAA	2	6	1870	1875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927461
31	NC_011898	TTG	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
32	NC_011898	TGT	2	6	1951	1956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
33	NC_011898	GGAAAA	2	12	1957	1968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
34	NC_011898	TGA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
35	NC_011898	AGA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
36	NC_011898	A	6	6	2134	2139	100 %	0 %	0 %	0 %	220927461
37	NC_011898	TGAA	2	8	2190	2197	50 %	25 %	25 %	0 %	220927461
38	NC_011898	CAAC	2	8	2213	2220	50 %	0 %	0 %	50 %	220927461
39	NC_011898	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927461
40	NC_011898	GTT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927461
41	NC_011898	GGA	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927461
42	NC_011898	TAAA	2	8	2334	2341	75 %	25 %	0 %	0 %	220927461
43	NC_011898	TTA	3	9	2358	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927461
44	NC_011898	TCAA	2	8	2380	2387	50 %	25 %	0 %	25 %	220927461
45	NC_011898	ATGA	2	8	2414	2421	50 %	25 %	25 %	0 %	220927461
46	NC_011898	ATA	2	6	2462	2467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927461
47	NC_011898	T	6	6	2557	2562	0 %	100 %	0 %	0 %	220927461
48	NC_011898	GAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
49	NC_011898	TA	3	6	2602	2607	50 %	50 %	0 %	0 %	220927461
50	NC_011898	TAC	2	6	2614	2619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927461
51	NC_011898	GGA	2	6	2728	2733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927462
52	NC_011898	TTA	2	6	2754	2759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927462
53	NC_011898	TCAA	2	8	2904	2911	50 %	25 %	0 %	25 %	220927462
54	NC_011898	ATTG	2	8	2954	2961	25 %	50 %	25 %	0 %	220927463
55	NC_011898	ATACAA	2	12	2995	3006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	220927463
56	NC_011898	T	6	6	3034	3039	0 %	100 %	0 %	0 %	220927463
57	NC_011898	ATTT	2	8	3081	3088	25 %	75 %	0 %	0 %	220927463
58	NC_011898	TAA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927463
59	NC_011898	GGT	2	6	3186	3191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927463
60	NC_011898	TTA	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
61	NC_011898	AAG	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
62	NC_011898	A	8	8	3263	3270	100 %	0 %	0 %	0 %	220927463
63	NC_011898	TGTTT	2	10	3299	3308	0 %	80 %	20 %	0 %	220927463
64	NC_011898	AGA	2	6	3314	3319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
65	NC_011898	TTTA	2	8	3320	3327	25 %	75 %	0 %	0 %	220927463
66	NC_011898	AGA	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
67	NC_011898	TTG	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927463
68	NC_011898	TCAG	2	8	3376	3383	25 %	25 %	25 %	25 %	220927463
69	NC_011898	CAA	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
70	NC_011898	AAC	2	6	3433	3438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
71	NC_011898	CAG	2	6	3461	3466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927463
72	NC_011898	AT	3	6	3493	3498	50 %	50 %	0 %	0 %	220927463
73	NC_011898	GCA	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927463
74	NC_011898	TAT	2	6	3530	3535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
75	NC_011898	AAG	2	6	3542	3547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927463
76	NC_011898	AAT	2	6	3557	3562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927463
77	NC_011898	GAT	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
78	NC_011898	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	220927463
79	NC_011898	TAC	2	6	3737	3742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927463
80	NC_011898	GAT	2	6	3759	3764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
81	NC_011898	ACA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927463
82	NC_011898	A	6	6	3866	3871	100 %	0 %	0 %	0 %	220927463
83	NC_011898	GAT	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927463
84	NC_011898	TTA	2	6	3976	3981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
85	NC_011898	TAT	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927463
86	NC_011898	T	7	7	4031	4037	0 %	100 %	0 %	0 %	220927463
87	NC_011898	TGT	2	6	4164	4169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927464
88	NC_011898	A	6	6	4179	4184	100 %	0 %	0 %	0 %	220927464
89	NC_011898	ACA	3	9	4210	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220927464
90	NC_011898	GA	3	6	4233	4238	50 %	0 %	50 %	0 %	220927464
91	NC_011898	GAA	3	9	4255	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927464
92	NC_011898	GGA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927464
93	NC_011898	TAT	2	6	4305	4310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927464
94	NC_011898	A	7	7	4324	4330	100 %	0 %	0 %	0 %	220927464
95	NC_011898	AT	3	6	4336	4341	50 %	50 %	0 %	0 %	220927464
96	NC_011898	ATC	2	6	4353	4358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927464
97	NC_011898	AT	3	6	4383	4388	50 %	50 %	0 %	0 %	220927464
98	NC_011898	AAT	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
99	NC_011898	TA	3	6	4532	4537	50 %	50 %	0 %	0 %	220927465
100	NC_011898	CAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
101	NC_011898	TGA	2	6	4597	4602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
102	NC_011898	ATT	2	6	4625	4630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
103	NC_011898	TACA	2	8	4734	4741	50 %	25 %	0 %	25 %	220927465
104	NC_011898	TAC	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
105	NC_011898	GGA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927465
106	NC_011898	GTT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
107	NC_011898	AT	3	6	4869	4874	50 %	50 %	0 %	0 %	220927465
108	NC_011898	GAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927465
109	NC_011898	TGA	2	6	5068	5073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
110	NC_011898	AG	3	6	5083	5088	50 %	0 %	50 %	0 %	220927465
111	NC_011898	A	7	7	5094	5100	100 %	0 %	0 %	0 %	220927465
112	NC_011898	GGT	2	6	5114	5119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220927465
113	NC_011898	TAA	2	6	5143	5148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
114	NC_011898	ATG	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
115	NC_011898	AT	3	6	5177	5182	50 %	50 %	0 %	0 %	220927465
116	NC_011898	GAAG	2	8	5186	5193	50 %	0 %	50 %	0 %	220927465
117	NC_011898	ATA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927465
118	NC_011898	ACT	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
119	NC_011898	AGC	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927465
120	NC_011898	AT	3	6	5358	5363	50 %	50 %	0 %	0 %	220927465
121	NC_011898	TTG	2	6	5499	5504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
122	NC_011898	TGT	2	6	5509	5514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
123	NC_011898	ATT	2	6	5524	5529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
124	NC_011898	AGA	2	6	5539	5544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927465
125	NC_011898	CGG	2	6	5550	5555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220927465
126	NC_011898	ATT	2	6	5564	5569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
127	NC_011898	AGC	2	6	5605	5610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927465
128	NC_011898	TTG	2	6	5721	5726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
129	NC_011898	AGGGA	2	10	5757	5766	40 %	0 %	60 %	0 %	220927465
130	NC_011898	TTA	2	6	5865	5870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927465
131	NC_011898	TGA	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927465
132	NC_011898	GCTGAT	2	12	5942	5953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220927465
133	NC_011898	TAC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927465
134	NC_011898	TTC	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220927465
135	NC_011898	TTG	2	6	6015	6020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927465
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